全额事业单位和差额事业单位两者都不错，关键是所在单位，想干什么工作等等，没有一定的可比性。
全额拨款事业单位也称为全供事业单位，也就是全额预算管理的事业单位，是其所需的事业经费全部由国家预算拨款的一种管理形式。这种管理形式，一般适用于没有收入或收入不稳定的事业单位;如学校、科研单位、卫生防疫、工商管理等事业单位，即人员费用、公用费用都要由国家财政提供。采用这种管理形式，有利于国家对事业单位的收入进行全面的管理和监督，同时使事业单位的经费得到充分的保证。
差额预算管理的事业单位即对有经常、稳定业务收入的单位，采取全面核算、收支挂钩、以收抵支的管理形式。既按定员定额指标核定的单位年度经费预算总额与单位创造的收入之比，支大于收的差额部分由国家预算补助，收大于支的部分上交国家财政。也可以说差额是按基数加增长的方式由财政负担，也就是财政给一部分，剩下的单位要自收自支的。
